Ваша ситуация подпадает под освидетельствование военно-врачебной комиссией (ВВК). Категория годности зависит от статьи 70 Расписания болезней («Отсутствие конечности»), так как ампутация стопы ниже колена считается приобретённым отсутствием части нижней конечности вследствие травмы.
Увольнение возможно по вашему рапорту (по состоянию здоровья, ст. 51 Федерального закона «О воинской обязанности и военной службе»)
Если не согласны с решением — обжалуйте в вышестоящей ВВК или суде (есть прецеденты, где категорию меняли).
Как раненый в БД, вы имеете право на страховку (до 3 млн руб. за тяжёлое увечье), пенсию, протез за счёт государства.