Входит ли туда оплата специалитету или тот договор автоматически "обнулился"?

С учётом моего уточнения выше далее:

Заключен трёхсторонний договор (я, поликлиника, минестерство здравоохранения) о целевом обучении. Обучение было как по специалитету… Работадатель хочет меня видеть очно на своём месте работы в рамках работы «врачом-стажером» и врачом-педиатром участковым.

Речь насколько я полагаю о Договоре целевого обучения от 26.08.2024 года  по специалитету педиатрия прилагаемого к вопросу.

Здесь следует исходить из того, что если в договор не вносились изменения путем заключения Соглашения по причине дальнейшего обучения в ординатуре, в части исполнения Вами в рамках данного договора обязанности по трудоустройству и отработке, в таком случае эти обязанности продолжают действовать по  данному Договору.

Порядок в настоящее время  регулирует также Постановление   Правительства РФ   от 27 апреля 2024 года № 555  «О целевом обучении по образовательным программам среднего профессионального и высшего образования», можете с ним ознакомиться полностью по следующей ссылке:https://docs.cntd.ru/document/1305814207

Из Постановления следует:

Типовая форма договора о целевом обучении по образовательной программе среднего профессионального или высшего образования

3. В случае если гражданин после завершения освоения основной   образовательной программы в соответствии с настоящим договором заключит с   заказчиком новый договор о целевом обучении, предусматривающий освоение

 ___________________________________________________________________________

 ___________________________________________________________________________

 (уровень образовательной программы <11>)

 11  Указывается, что гражданин и заказчик вправе заключить новый договор о целевом обучении, предусматривающий освоение ...программы ординатуры...

Т.е. как видно из применимого Порядка в период которого с Вами был заключен Договор целевого обучения, в случае если в Договоре целевого обучения есть такое условие. Заказчик будет обязан его исполнять т.е. касающегося дальнейшего обучения в ординатуре.

И такое условие предусмотрено Типовой формой утвержденной Порядком.

Но в случае если такого условия в договоре нет, заказчик не обязан им руководствоваться, а для внесения такого условия в Договор необходимо заключить к нему соглашение с Заказчиком на что требуется его согласие.

Порядок в настоящее время  регулирует также Постановление   Правительства РФ   от 27 апреля 2024 года № 555  «О целевом обучении по образовательным программам среднего профессионального и высшего образования», можете с ним ознакомиться полностью по следующей ссылке:https://docs.cntd.ru/document/1305814207

Из Постановления следует:

33. Изменения, которые вносятся в договор о целевом обучении, оформляются дополнительными соглашениями к нему. Указанные дополнительные соглашения заключаются в порядке, соответствующем порядку заключения договора о целевом обучении, определенному пунктом 21 настоящего Положения.

Далее я продолжу в следующем ответе ниже.

Так, по условиям договора, Вы должны работать в должности -врач педиатр. 

Также у Вас указан код и наименование специальности подготовки  -код и наименование специальности подготовки 31.08.19 Педиатрия. 

Согласно пп. «в» типовой формы договоре. — VIII. Права и обязанности гражданина, утвержденной Постановлением Правительства РФ от 27.04.2024 N 555, гражданин обязан

в) заключить трудовой договор (дополнительное соглашение к ранее заключенному трудовому договору) после завершения освоения основной образовательной программы и осуществить трудовую деятельность на условиях, установленных разделом III настоящего договора; 

Если по условиям договора, именно в соответствии с освоенной Вами программой трудовой договор не будет заключен, то с Вашей стороны нарушения условий договора, что влечет за собой последствия, предусмотренные договором,  Постановлением Правительства РФ от 27.04.2024 N 555. 

В этом случае, предусмотрена выплата штрафа, размер которого определяется согласно п. 100 Постановления Правительства РФ от 27.04.2024 N 555. 

Могу ли я не соглашаться на работу врачом-стажером?

Вы можете не соглашаться на трудоустройстве в этой должности. Так, по условиям договора, у Вас обязанность по трудоустройству в должности врач педиатр. 

Вы приложили доп. соглашение, в рамках которого Вы должны были освоить программу ординатуры  — код и наименование специальности подготовки 31.08.19 Педиатрия. 

Так, согласно  Приказ Министерства науки и высшего образования Российской Федерации от 09.01.2023 № 9
«Об утверждении федерального государственного образовательного стандарта высшего образования — подготовка кадров высшей квалификации по программам ординатуры по специальности 31.08.19 Педиатрия» это программа ординатуры. 

Соответственно, обязанность по трудоустройству у Вас возникает после освоения указанной программы. 

Какую компенсацию я должна буду выплатить, если расторгну договор сейчас и после окончания ординатуры

Если же сейчас Вы расторгнете этот договор, то также в отношении Вас возникают последствия, предусмотренные п. 99-100 Постановления Правительства РФ от 27.04.2024 N 555. 

Кроме того, возникает ответственность по выплате расходов, связанных с предоставлением мер поддержки, которые предоставляются по условиям приложенного Вами договора. 

Так, согласно п. 91 Постановления Правительства РФ от 27.04.2024 N 555. 

91. Гражданин, не исполнивший обязательства по освоению образовательной программы и (или) осуществлению трудовой деятельности в течение срока трудовой деятельности или расторгнувший договор о целевом обучении в одностороннем порядке, возмещает заказчику расходы, связанные с предоставлением мер поддержки, если гражданин не освобожден от ответственности за неисполнение обязательств по договору о целевом обучении.

Выплата штрафа также осуществляется, в соответствии с п. 98-100 Постановления Правительства РФ от 27.04.2024 N 555. 

Так, согласно п. 103 Постановления Правительства РФ от 27.04.2024 N 555. 

103. Заказчик или гражданин, обязанный выплатить штраф, не позднее 12 месяцев со дня получения требования о выплате штрафа выплачивает штраф посредством перечисления денежных средств на счет, указанный в требовании о выплате штрафа.

В случае отказа в указанный законом срок добровольно выплатить штраф, может последовать исковое заявление в суд  с данным требованием.