Может ли второй собственник чинить какие либо препятствия для проживания моего сына в этой квартире и есть ли еще какие нюансы?

1) Кто вы сейчас с точки зрения права на квартиру?
Вы — наследник по завещанию. Если вы уже подали нотариусу заявление о принятии наследства, то с точки зрения закона принятое наследство считается принадлежащим вам с даты смерти тёти (12 июня), даже до регистрации права в ЕГРН. Это значит, вы вправе владеть и защищать свою долю уже сейчас, а свидетельство и регистрация лишь фиксируют это в реестре. Но важно успеть завершить оформление у нотариуса до 12 декабря. 

2) Может ли ваш сын жить в квартире «по вашему решению»?
Только при соблюдении правил общей долевой собственности. Вещь в долевой собственности (квартира) используется по соглашению всех сособственников; если согласия нет — порядок пользования устанавливает суд. Самостоятельно «вселить» третье лицо (в том числе по договору безвозмездного пользования) без согласия второй владелицы рискованно: суды квалифицируют такие ситуации как нарушение прав сособственника. Верховный суд в 2025 г. прямо подтвердил: передавать помещение третьим лицам (включая наём) без согласия всех — нельзя. По смыслу это распространяют и на «безвозмездное пользование», потому что фактически результат один — в квартире поселяется третье лицо. 

Момент тонкий: «сын — член семьи собственника». Но ст. 31 ЖК РФ про равное право членов семьи действует безусловно для собственника всего жилья. В долевой собственности вселение члена семьи одного владельца затрагивает права другого владельца; практику выстроили так: требуется согласование порядка пользования/согласие второго собственника либо судебное определение. И уж точно без согласия не получится оформить постоянную регистрацию сына — МВД требует согласие всех собственников при долевой собственности (п. 49.4 Адм. регламента № 984). 

3) Нужна ли нотариальная форма договору «безвозмездного пользования» с сыном?
Нет, для ссуды нотариат не обязателен — простая письменная форма. Но такой договор не связывает второго собственника, если она его не подписывала: он действует только между вами и сыном и не даёт ему «преимущество» перед сособственницей. 

4) Обязаны ли вы отдать ключи второй собственнице и может ли она «мешать» проживанию сына?
Ключи — да. Каждый сособственник имеет право владеть и пользоваться общим имуществом; лишать доступа — нарушение, которое устраняется негаторным иском (обязание передать ключи/не чинить препятствий). Поэтому ключи передайте под расписку; смена замков — только с выдачей ей комплектов. Если сын вселён без её согласия и фактически занимает всю 1-комнатную квартиру, вторая собственница вправе требовать либо: а) прекращения препятствий (выселения третьего лица), либо б) определения порядка пользования, либо в) компенсации за лишение её возможности пользования (обычно — как неосновательное обогащение/убытки). 

5) Можно ли «узаконить» проживание сына так, чтобы рисков было меньше?
Да, рабочая дорожная карта такая:

Сделать предложение о порядке пользования. Письменно (ценным письмом/электронной почтой с подтверждением) предложите сособственнице вариант:
— вы (сын) пользуетесь комнатой/всем жилым пространством;
— доступ для неё обеспечивается (ключи, свободный вход, правила безопасности, уведомление о длительных визитах — это допустимо только по соглашению);
— компенсация за «перекрытие» её доли (если фактически занимаетесь всем жильём), размер — по рынку пропорционально её доле, либо ноль, если она сама не возражает. Если не договоритесь — подавайте иск об определении порядка пользования (суд иногда закрепляет эксклюзивное пользование за одним с компенсацией другому; в 1-комнатных квартирах суды часто приходят именно к денежному способу). 
Не оформляйте регистрацию сына без согласия второй собственницы. Для постоянной регистрации по долевой — требуется согласие всех собственников. Исключения — только для собственника-одиночки или для муниципального найма (не ваш случай).
Передайте ключи и зафиксируйте это актом. Ключи (всё, что открывает вход) — под расписку/актом передачи, где сразу пропишите: «в случае смены замка каждая сторона в течение 24 часов предоставляет другой стороне комплект ключей». Это снижает риск негаторного иска к вам. 
Договор с сыном оставляйте как внутренний. Он полезен для вашей «семейной дисциплины» (обязанности бережного пользования, коммуналка, срок), но к спорам с сособственницей аргумент слабый, если она не согласна. Если она подпишет трипартийное соглашение (вы–она–сын) — вот это уже надёжно.
Готовьтесь к альтернативе: если сособственница хочет сама пользоваться квартирой — придётся делить фактическое пользование (что в «однушке» неудобно) или переходить к переговорам о выкупе доли/компенсации за пользование. В противном случае суд может: а) запретить вам содержать в квартире третьих лиц без её согласия, б) установить порядок пользования, в) взыскать компенсацию. Линия ВС 2025 года на запрет вселять третьих лиц без согласия сособственников — устойчивая. 
6) Типичные ошибки в таких историях (и почему это важно)
«Замкнуть» квартиру и не дать ключи. Это почти гарантированный проигрыш по негаторному иску (обязание передать ключи/допустить к пользованию). Суд смотрит на это как на прямое нарушение ст. 247 ГК РФ. 
Регистрация сына без согласия сособственницы. МВД откажет, а попытка «додавить» через суд обречена: регламент и практика требуют согласия всех. 
Сдача/«безвозмездное» вселение посторонних без оглядки на второго собственника. Прямо бьётся с позицией ВС (сделки, дающие право проживания третьим лицам в долевой квартире, — только по согласию всех). 
Надежда, что «не пользовалась — значит прав нет». Непользование долей не лишает права собственника на доступ и участие в принятии решений. Компенсацию за прошлые годы она не потребует, если вы её не лишали пользования, но с момента конфликта риски быстро растут. 
7) Что делать прямо сейчас 
У нотариуса: убедитесь, что заявление о принятии наследства подано; заранее запросите выдачу свидетельства и затем зарегистрируйте право в ЕГРН (это упростит любые переговоры/суды). 
С ключами: передайте второй собственнице комплект ключей под акт (2 экз.). Сфотографируйте, сохраните. 
Письмо-предложение: направьте проект соглашения о порядке пользования (ключи, доступ, запрет вселения третьих лиц без взаимного письменного согласия, правила пользования, компенсация при эксклюзивном проживании сына). Дайте разумный срок на ответ (10–14 дней). 
Если откажет/тянет: подайте в суд иск об определении порядка пользования и (при необходимости) о признании отсутствия права вселения третьих лиц без согласия сторон либо о взыскании/отсутствии компенсации — в зависимости от позиции. Приложите доказательства попыток договориться. В «однушках» это часто приводит к закреплению за одним фактического пользования с компенсацией другому. 
Регистрация сына: делайте только при наличии письменного согласия второй собственницы (или после судебного решения, где это прямо допустят). Иначе будет отказ МВД.