15 ноября я вернулся в Москву, и при прилёте мне не выдали миграционную карту

Добрый вечер, Zafar!
У вас есть РВП, а значит по Федеральному закону № 115-ФЗ «О правовом положении иностранных граждан в РФ» вы являетесь временно проживающим иностранным гражданином, и законность вашего нахождения в России подтверждается паспортом, штампом РВП и регистрацией по месту жительства, а не миграционной картой (ст. 2, 6 115-ФЗ).
Миграционная карта в самом 115-ФЗ определяется как документ, который подтверждает право безвизового иностранца на временное пребывание и служит для контроля этого пребывания, то есть ключевую роль она играет именно для «временно пребывающих», а не для обладателей РВП (ст. 2 115-ФЗ).
Общая норма Федерального закона № 114-ФЗ «О порядке выезда из РФ и въезда в РФ» (ст. 25.9) говорит, что иностранец при въезде обязан получить и заполнить миграционную карту и сдать её при выезде, но это правило действует с учётом международных договоров РФ и не отменяет ваш статус временно проживающего по РВП.
Между РФ и Беларусью действует Соглашение об использовании миграционной карты единого образца от 05.10.2004, в которое в 2017 году внесён Протокол: теперь в подп. «д» п. 2 ст. 3 прямо сказано, что миграционная карта не заполняется и не предъявляется при въезде/выезде иностранцами, временно или постоянно проживающими на территории государств-участников, то есть в том числе обладателями РВП в РФ.
Вы при вылете из России сдали миграционную карту, как того требует закон, а при возвращении в РФ через Минск попытались получить новую, но вам её не выдали — в такой ситуации по ст. 2.1 КоАП РФ нет вашей вины, потому что вы физически не могли исполнить обязанность по причинам, зависящим от должностных лиц.
РВП аннулируется, в том числе, если иностранец находился за пределами РФ более шести месяцев суммарно в течение календарного года (подп. 11 п. 1 ст. 7 115-ФЗ), но ваша командировка в Минск на 5 дней никак не подпадает под это основание и не создаёт рисков для разрешения.
На практике МВД и в разъяснениях (в том числе Письмо МВД России от 04.08.2020 № 3/207710721571) ориентируются именно на Соглашение с Беларусью: для лиц с РВП/ВНЖ поездки через Беларусь без миграционной карты не считаются нарушением, однако при желании вы можете обратиться в подразделение по вопросам миграции по месту жительства с коротким письменным обращением, чтобы иметь на руках официальный ответ.
В вашей ситуации вы действовали правильно и добросовестно, а с точки зрения закона оснований ни для штрафа, ни тем более для аннулирования РВП из-за этой поездки нет — достаточно носить с собой паспорт, РВП и регистрацию и спокойно, без страха, продолжать жить и работать в России.

Здравствуйте!

Между РФ и РБ действительно упрощенный режим, но освобождение от заполнения миграционной карты касается только граждан Беларуси (ст. 3 Соглашения от 24.01.2006).

Граждане одной Стороны, прибывшие на территорию другой Стороны, в течение 90 дней с даты въезда освобождаются от регистрации в компетентных органах по месту пребывания.

Для граждан третьих стран (даже с РВП) наличие миграционной карты обязательно.

Ст. 25.9 Федерального закона от 15.08.1996 N 114-ФЗ указывает

Иностранный гражданин или лицо без гражданства при въезде в Российскую Федерацию обязаны получить и заполнить миграционную карту. Миграционная карта подлежит сдаче (возврату) в пункте пропуска через Государственную границу Российской Федерации при выезде иностранного гражданина или лица без гражданства из Российской Федерации.

Ст. 3 Соглашения между РФ и РБ от 05.10.2004

Компетентными органами государств Сторон иностранному гражданину при въезде на территории государств Сторон выдается для заполнения миграционная карта.

В базе данных пограничной службы (ЦБД УИГ) Вы выехали 10 ноября (сдали карту), но юридически не въехали 15 ноября (карту не выдали), отсутствие миграционной карты является нарушением режима пребывания.

Вам нужно легализовать свое нахождение через МВД внутри страны согласно Постановлению Правительства РФ от 16.08.2004 N 413

Согласно п. 11 Постановления Правительства РФ от 16.08.2004 N 413

В случае порчи или утраты миграционной карты иностранный гражданин обязан в течение 3 дней заявить об этом в ближайший по месту своего нахождения территориальный орган федерального органа исполнительной власти, ведающего вопросами миграции.

Указанный орган при предъявлении иностранным гражданином документов, на основании которых он въехал в Российскую Федерацию, выдает ему бесплатно дубликат миграционной карты в порядке, определяемом федеральным органом исполнительной власти, ведающим вопросами внутренних дел.

Обратитесь в отделение МВД по вопросам миграции (где у Вас регистрация по РВП) в течение 3-х рабочих дней (желательно не затягивать). Напишите заявление в свободной форме о выдаче дубликата миграционной карты в связи с ее невыдачей на пункте пропуска. Обязательно приложите паспорт с РВП, посадочные талоны на рейс Минск–Москва (они подтверждают дату и факт пересечения границы). Сотрудники МВД проверят списки пассажиров и выдадут Вам дубликат миграционной карты со штампом, либо проставят отметку в базе. 

Здравствуйте.

 У меня есть РВП. Подскажите, пожалуйста, как мне поступить в этой ситуации и будут ли за это какие-либо последствия?

Для подтверждения законности вашего пребывания в России, особенно при наличии РВП, вам желательно иметь документы, фиксирующие факт пересечения границы. Миграционной карты нет, поэтому крайне важно сохранить другие доказательства вашего нахождения в Беларуси.

Сохраните все документы, подтверждающие ваше пребывание в Минске: билеты на самолет/поезд (особенно посадочный талон), чеки из гостиницы, счета из ресторанов, билеты на мероприятия и т.д. Любые документы с указанием дат и вашего имени будут полезны.
Если возможно, получите справку от организации, в которую вы ездили в командировку в Минске, с указанием периода вашего пребывания.
Обращение в отделение МВД по вопросам миграции:

Ст. 25.9 Федерального закона от 15.08.1996 N 114-ФЗ

Обратитесь в территориальный орган МВД по вопросам миграции по месту вашей регистрации (там, где вы получали РВП).
Опишите ситуацию и предъявите собранные документы.
Уточните, какие действия вам необходимо предпринять, чтобы избежать возможных проблем в будущем. Возможно, вам предложат составить заявление о въезде или предложат другие варианты.
 

 Проблемы при продлении РВП или получении ВНЖ: Отсутствие документов, подтверждающих ваше нахождение за пределами РФ, теоретически может вызвать вопросы при продлении РВП или подаче на ВНЖ. Именно поэтому так важно собрать доказательства вашей командировки.
Административные правонарушения: Теоретически, отсутствие миграционной карты может быть расценено как нарушение миграционного законодательства. Однако, учитывая наличие РВП и соглашение между Россией и Беларусью (а также наличие доказательств пребывания в Беларуси), вероятность этого невелика.

Здравствуйте!

Нет проблем, расскажу детально.

Действительно, между Россией и Беларусью существует соглашение Таможенного союза, согласно которому иностранные граждане, имеющие действующее разрешение на временное проживание  или вид на жительство в одной из стран Союза, пересекают границу свободно, без заполнения миграционной карты.

Это закреплено Федеральным законом №115-ФЗ «О правовом положении иностранных граждан в Российской Федерации», статья 5 которого предусматривает освобождение от обязанности заполнять миграционные карточки при поездках внутри Союзного государства.

Поскольку у Вас имеется РВП, Вы освобождаетесь от необходимости получать миграционную карту при пересечении границы между Россией и Беларусью. Соответственно, никаких последствий за отсутствие миграционной карты в Вашем случае не последует.

Советую сохранять подтверждение пересечения границы (авиабилеты, посадочные талоны), чтобы подтвердить соблюдение сроков пребывания в России, если возникнет необходимость доказать законность нахождения в стране.