Как это оформить и вывести ее из доли квартиры

Здравствуйте, Матвей!
Если при покупке квартиры использовался материнский капитал и вы разводитесь, долю жены и ребёнка можно выделять только после погашения ипотеки, так как маткапитал целевое средство, вы совершенно правы. Если супруга согласна на возврат маткапитала деньгами, это можно оформить через соглашение о разделе имущества и уступке прав на материнский капитал: нужно подписать письменное соглашение, в котором вы фиксируете сумму возврата и порядок передачи денег, после чего она отказывается от прав на долю в квартире. Одновременно нужно оформить нотариальное соглашение или договор дарения/отчуждения доли, чтобы официально вывести её из доли квартиры, и при этом соблюсти требования ПФР о распоряжении маткапиталом. Таким образом, после выплаты согласованной суммы и оформления документов супруга официально лишается доли, и квартира остаётся на вас с учётом прав ребёнка.