Елена Здравствуйте! Срок исковой давности применяется в гражданском судопроизводстве, и может быть применен судом только по заявлению стороны участвующей в дел.
Но Ваш вопрос на данном этапе в другом. В налоговую инспекцию сведения об имуществе которым обладает физическое лицо представляет регистрирующий орган, который зачастую это либо вообще не делает, либо с задержкой.
Вы говорите о том, что квартиры не существует. Соответственно Вам необходим документ подтверждающий это, который необходимо представить в налоговый орган. Если вы не сможете, такой получить, возьмите в регистрационной палате субъекта, справку — выписку из единого государственного реестра регистрации прав на недвижимое имущество и сделок с ним, о том, что за вами такой квартиры в собственности не числится и представьте этот документ в налоговый орган, для произведения перерасчета, указанной задолженности.
Надеюсь полно и доступно объяснил, Удачи Вам, если не затруднит оставьте отзыв.