Здравствуйте!
«ООО находится в процессе исключения из ЕГРЮЛ по причине недостоверности сведений об одном (умершем) учредителе»
Сам по себе факт исключения юридического лица из ЕГРЮЛ по решению налогового органа может повлечь ограничения для лиц, которые на момент исключения являлись руководителями или участниками общества.
«Второй учредитель, он же директор, не ведет деятельность, долгов перед бюджетом и контрагентами нет»
Это важное обстоятельство. Ограничение, предусмотренное пп. «ф» п. 1 ст. 23 Федерального закона № 129-ФЗ «О государственной регистрации юридических лиц и индивидуальных предпринимателей», обычно применяется к лицам, которые были руководителями или участниками общества, исключенного из ЕГРЮЛ как недействующего, при наличии задолженности перед бюджетом либо если задолженность признана безнадежной к взысканию.
Подпункт «ф» пункта 1 статьи 23 Закона № 129-ФЗ: «Не допускается государственная регистрация юридического лица с участием лица, которое являлось руководителем или участником юридического лица, исключенного из ЕГРЮЛ в административном порядке и имевшего задолженность перед бюджетом...»
Если у общества действительно отсутствуют долги перед бюджетом и иными кредиторами, риск применения трехлетнего запрета существенно ниже. Однако на практике налоговые органы иногда отказывают в регистрации, и тогда приходится обжаловать такой отказ.
Рекомендую до исключения по возможности подать в налоговый орган актуальные сведения об умершем участнике либо решить вопрос через наследников, если это еще возможно. Добровольная ликвидация или приведение сведений в соответствие обычно предпочтительнее административного исключения из ЕГРЮЛ.
Если вам необходимо разобрать ваш вопрос детально, то напишите мне в личный чат. Возможна подготовка правовой позиции и анализ рисков применительно к вашей ситуации.