Вычет ндс по услугам нерезидента

Добрый день!

Возник такой вопрос:

Организация заключила соглашение с нерезидентом РФ на выполнение базового проекта (предпроектные работы). Документация передана в электронном виде, бумажная копия передана просто при личной встрече. Налоговая отказывает в вычете, в том числе, по причине того, что по условиям договора нужно было передать и бумажную копию.

При этом, утверждает, что если получена бумажная копия, то нужно было оформлять таможенную декларацию.

В договоре указано, что информация передается как бумажная, так и электронно.

Вопрос:

Правомерен ли такой довод налоговой?