Добрый день!
Сначала налоговая должна была направить Вам акт налоговой проверки, вы могли бы его обжаловать, а только потом налоговые органы направляют решение и требование об уплате.
В требование об уплате должен быть указан срок, до которого Вам необходимо выплатить нужную сумму, и меры административной ответственности, применяемые к Вам, если Вы в срок эту сумму не выплатите.
Однако обратите внимание на п. 5 ст. 220 НК РФ
5. Имущественные налоговые вычеты, предусмотренные подпунктами 3 и 4 пункта 1 настоящей статьи, не предоставляются в части расходов налогоплательщика на новое строительство либо приобретение на территории Российской Федерации жилого дома, квартиры, комнаты или доли (долей) в них, покрываемых за счет средств работодателей или иных лиц, средств материнского (семейного) капитала, направляемых на обеспечение реализации дополнительных мер государственной поддержки семей, имеющих детей, за счет выплат, предоставленных из средств бюджетов бюджетной системы Российской Федерации, а также в случаях, если сделка купли-продажи жилого дома, квартиры, комнаты или доли (долей) в них совершается между физическими лицами, являющимися взаимозависимыми в соответствии со статьей 105.1 настоящего Кодекса.
В вашем случае, если вы приобрели квартиру по программе «Военная ипотека» (т.е. за счет средств из бюджета РФ) и не тратили собственных денег на приобретение квартиры, то и права на имущественный налоговый вычет при покупке квартиры или по ипотечным процентам Вы не имели.
Екатерина, не видя документы, невозможно сделать вывод. Ищите юриста, который занимается налоговыми спорами, и привлекайте к делу.
Если налоговая не докажет, что направляла Вам документы — акт, решение и требование, то административной ответственности быть не должно, пени и штрафов тоже. Тот факт, что была проведена камеральная проверка, производились выплаты, надо использовать.
Удачи!