Ляйсан, если квартира приобретена в браке, то она является совместно нажитым имуществом, если иное не определено брачным договором (при его наличии). При этом раздел может быть осуществлен как до расторжения брака, так и после, как в судебном порядке, так и во внесудебном.
Если вы хотите произвести раздел одновременно с разводом, исковое заявление нужно будет подавать в районный суд, а не в мировой, как просто при разводе.
При разделе ипотечной квартиры третьим лицом в процесс нужно привлечь банк, выдавший кредит.
Суд, как правило, если стороны не предоставили веских аргументов, почему следует отступить от равенства долей, делит пополам и квартиру и кредит. То, что с вами остаются двое детей может быть таким аргументом, однако, суд учтет и то, что только один ребенок у вас с мужем общий, а также наличие других помещений, в которых дети имеют право пользования (если такие доказательства будут у суда).
Кроме того, одного вашего утверждения, что ребенок остается с вами, не достаточно, ведь муж может и возражать, так что, возможно, придется еще заявить требование об определении места жительства ребенка с вами.