В трудовой стаж не включили сроки моего обучения в целевой ординатуре и прохождения курсов специализации по направлению союзного министерства

На какую статью мне сослаться, чтобы обратиться в суд?

Это не указано в статьях кодекса, надо в суд предоставить множество документов, чтобы это включили в стаж и должностные инструкции и штатные расписания за тот период. И всякие подведомственные инструкции и приказы Минздрава смотреть за тот период.