Человек подал на меня заявление за клевету, где должен быть процесс по территориальной подсудности?

Данное преступление считается оконченным в тот момент, когда ваше заявление поступило. Следовательно, место совершения — это место поступления вашего заявления.

Спасибо за ответ.Т.е.если я со своей электронной почты отправил в другой город обращение то там и будет рассматриваться дело?

Нет. Клевета это преступление с формальным составом. Оно окончено с момента совершения Вами определенных действий. Поэтому местом его окончания будет то место откуда Вы отправили сообщение.

Подсудность изменяется в том числе по ходатайству стороны по правилам, установленным ст 35 УПК РФ.

Но почему то мировой судья по месту моего жительства отказалась рассматривать это заявление и передала его по месту получения.

Ну не могу сказать почему она это сделала, однако хотел бы у нее спросить, куда она передала бы дело если бы Вы продублировали сообщение по почте в разные концы страны чтобы его получили разные адресаты во всех субъектах РФ. Видимо тогда ситуация не была бы для нее столь однозначной и она приняла бы дело к своему производству.