Здравствуйте, Алексей. Никак. Не выделив доли детям, вы нарушаете требования закона и данное вами нотариально заверенное обязательство о выделении. Отказ от выдела долей может служить основанием для взыскания с вам маткапитала в ПФР. Бабушка и ее квартира не имеют никакого отношения к вашей обязанности распределить квартиру в пользу всех членов семьи.
Вопрос «куда и как распределить» — непонятен. Тут нет никаких вариантов. Разумеется, доли должны быть выделены в купленной за счет маткапитала квартире. Вам это должно быть известно, т.к. вы давали соответствующее обязательство. Распределить доли очень просто. Составляете соглашение о выделе долей и регистрируете переход права в Росреестре. А затем обращаетесь в органы опеки за согласованием продажи квартиры.