Здравствуйте.
Насколько понимаю, речь о пошлине, уплачиваемой при обращении к нотариусу за оформлением наследства. Такая пошлина уплачивается в зависимости от стоимости унаследованного имущества:
Налоговый кодекс Российской Федерации (часть вторая)
Статья 333.24. Размеры государственной пошлины за совершение нотариальных действий
22) за выдачу свидетельства о праве на наследство по закону и по завещанию:
детям, в том числе усыновленным, супругу, родителям, полнородным братьям и сестрам наследодателя — 0,3 процента стоимости наследуемого имущества, но не более 100 000 рублей;
Если Вы заявляете о супружеской доле и к наследству остается только половина имущества, то и пошлину Вы заплатите меньше — 0,3% стоимости 1/2 доли в каждой квартире, а не от полной стоимости квартир.
Вам выгоднее выделить свою супружескую долю и наследовать остальное.
Обращаю внимание, что нотариус в любом случае будет выяснять статус имущества и наличие режима совместной собственности супругов — если будет установлено, что имущество совместно нажитое, то нотариус просто не позволит Вам наследовать всё имущество, потребуется выделить супружескую долю и принять в наследство оставшуюся часть.
Если все же речь идет о том, что Вы хотите продавать квартиры и хотите получить налоговый вычет в размере суммы продажи в соответствии со ст.220 НК, то здесь, для определения срока владения квартирой, находящейся в совместной собственности супругов, действует правило, в соответствии с которым она будет считаться находящейся в Вашей собственности не с момента получения свидетельства о праве на наследство, а с момента первоначальной регистрации права собственности на совместное имущество, не зависимо от того, на кого из супругов оно было зарегистрировано. Посмотрите например здесь
При наличии вопросов, задавайте. Но в целом я не вижу причин для беспокойства. С уважением Евгений Беляев