Правомерно ли со стороны налоговиков оформление такого зачета средств?

Добрый день!

Действия налогового органа в данной ситуации не правомерны, если в квитанции по уплате транспортного налога за 2016 г. был указан период за который вносился данный платеж.

Задолженность по налогу за 2014 г. будет числиться за вами до тех пор пока вы её не погасите. Всё это время на сумму недоимки будут начислять проценты за неуплату налога, однако самостоятельно взыскать сумму налога за 2014 г. налоговый орган не может. 

Согласно п.3 ст. 363 Налогового кодекса РФ физические лица уплачивают транспортный налог на основании налогового уведомления, которое может быть направлено налоговым органом не более чем за три налоговых периода предшествующих календарному году его направления.

Сделать самостоятельно зачет платежей налоговый орган не имеет права. Поэтому действия налогового органа, в вашем случае, можно оспорить в судебном порядке на основании истечения срока давности для взыскания транспортного налога за 2014, при этом подтвердив оплату налога за 2016 г.