Правомерны ли действия директора в нашем случае?

меня больше интересует ИМЕЕТ ЛИ ПРАВО АДМИНИСТРАЦИЯ ШКОЛЫ ИСПРАВЛЯТЬ ИЛИ УДАЛЯТЬ ОЦЕНКИ ИЗ ЭЛ, ЖУРНАЛА БЕЗ СОГЛАСИЯ УЧИТЕЛЯ?

В вашей школе должен быть принят локальный нормативный акт. Его название может быть разным, например, Положение о системе оценок. В этом документе также должен быть прописан порядок пересмотра оценок. 

Родители вправе обжаловать действия педагога в порядке статьи 45 Федерального закона «Об образовании в Российской Федерации.

Федеральный закон от 29.12.2012 N 273-ФЗ (ред. от 03.08.2018) „Об образовании в Российской Федерации“Статья 45. Защита прав обучающихся, родителей (законных представителей) несовершеннолетних обучающихся
 

1. В целях защиты своих прав обучающиеся, родители (законные представители) несовершеннолетних обучающихся самостоятельно или через своих представителей вправе:
1) направлять в органы управления организацией, осуществляющей образовательную деятельность, обращения о применении к работникам указанных организаций, нарушающим и (или) ущемляющим права обучающихся, родителей (законных представителей) несовершеннолетних обучающихся, дисциплинарных взысканий. Такие обращения подлежат обязательному рассмотрению указанными органами с привлечением обучающихся, родителей (законных представителей) несовершеннолетних обучающихся;
2) обращаться в комиссию по урегулированию споров между участниками образовательных отношений, в том числе по вопросам о наличии или об отсутствии конфликта интересов педагогического работника;
3) использовать не запрещенные законодательством Российской Федерации иные способы защиты прав и законных интересов.
2. Комиссия по урегулированию споров между участниками образовательных отношений создается в целях урегулирования разногласий между участниками образовательных отношений по вопросам реализации права на образование, в том числе в случаях возникновения конфликта интересов педагогического работника, применения локальных нормативных актов, обжалования решений о применении к обучающимся дисциплинарного взыскания.
3. Комиссия по урегулированию споров между участниками образовательных отношений создается в организации, осуществляющей образовательную деятельность, из равного числа представителей совершеннолетних обучающихся, родителей (законных представителей) несовершеннолетних обучающихся, работников организации, осуществляющей образовательную деятельность.
4. Решение комиссии по урегулированию споров между участниками образовательных отношений является обязательным для всех участников образовательных отношений в организации, осуществляющей образовательную деятельность, и подлежит исполнению в сроки, предусмотренные указанным решением.
5. Решение комиссии по урегулированию споров между участниками образовательных отношений может быть обжаловано в установленном законодательством Российской Федерации порядке.
6. Порядок создания, организации работы, принятия решений комиссией по урегулированию споров между участниками образовательных отношений и их исполнения устанавливается локальным нормативным актом, который принимается с учетом мнения советов обучающихся, советов родителей, а также представительных органов работников этой организации и (или) обучающихся в ней (при их наличии).

Таким образом, родители „нового“ мальчика для пересмотра оценок должны были обратиться к директору школы или в комиссию по урегулированию споров с письменным заявлением. А дальше администрация школы, педагогический совет или комиссия по урегулированию споров (повторяю, надо смотреть локальный нормативный акт школы, где прописан порядок действий) должны принять решение по этой жалобе. В случае ее удовлетворения — пересмотреть или отменить оценки, если они посчитают их заниженными.