Как провести деньги, вырученные от продажи помещения?

Добрый день, можно внести и наличными, и безналичным путем, это не принципиально и оба варианта законны. Налоги компании зависят от применяемой системы налогообложения — уплачивается налог на сумму дохода соответственно своему налоговому режиму и налоговой ставке.