По каким тарифам должны оплачивать билеты работникам?

Здравствуйте. 

Все зависит от порядка назначения и выплаты компенсации, так как у каждой организации свой порядок, федеральных согласно постановлению Правительства РФ, региональных порядку утвержденному субъектом РФ, муниципальных порядку муниципалитета, а не бюджетные организации самостоятельно принимают свои локальные акты о такой компенсации.

Так к пример если брать Постановление Правительства РФ от 12.06.2008 N 455 

от 12 июня 2008 года N 455

О порядке компенсации расходов на оплату стоимости проезда и провоза багажа к месту использования отпуска и обратно для лиц, работающих в федеральных государственных органах, государственных внебюджетных фондах Российской Федерации, федеральных государственных учреждениях, расположенных в районах Крайнего Севера и приравненных к ним местностях, и членов их семей

ПРАВИЛА

компенсации расходов на оплату стоимости проезда и провоза багажа к месту использования отпуска и обратно для лиц, работающих в федеральных государственных органах, государственных внебюджетных фондах Российской Федерации, федеральных государственных учреждениях, расположенных в районах Крайнего Севера и приравненных к ним местностях, и членов их семей 

воздушным транспортом — в салоне экономического класса

произведенные расходы на проезд по более высокой категории проезда, чем установлено пунктом 5 настоящих Правил, компенсация расходов производится на основании справки о стоимости проезда

7. При отсутствии проездных документов компенсация расходов производится

при наличии только воздушного сообщения — по тарифу на перевозку воздушным транспортом в салоне экономического класса;

http://docs.cntd.ru/document/9...