Здравствуйте, Валентина. Во многих регионах есть такое требование, когда возможность постановки на учет прямо связана именно с потосянной регистрацией в данном населенном пункте. Хотя, по большому счет, это условие — антиконституционно. Выходом было бы признание для вас факта постоянного проживания в Калуге и обязания администрации поставить вас на учет.
Либо признать требование местного закона о постоянной регистрации противоречащим Конституции РФ. В зависисмости от конкретных условий. Думаю, без помощи юриста вряд ли вам удастся с этим справиться.
Еще вариант — почему бы вашей сестре не зарегистрировать вас в квартире постоянно (и почему она не регистрировала вас, пока вы жили у нее?), но не как члена семьи, собрать документы, подтверждающие опекунство и, если понадобится, установить факт постоянного проживания в городе. В общем, заочно определить наиболее верный путь невозможно. Так что рекомендации — предположительного характера.
Но как малоимущая, вы можете получить жилье лет через 50. Если сестра была вашим опекуном в связи с тем, что вы — сирота, вам нужно встать в льготную очередь, именно как сироте. Шансы получить квартиру гораздо выше.