Здравствуйте.
Поменялся статус одной из сторон договора (ст.23 Гражданского кодекса РФ(ГК РФ), в действующем гражданском законодательстве не предусмотрено аннулирования договора в силу изменения статуса одной из сторон, при этом согласно ст. 452 Гражданского кодекса РФ возможно изменение договора в форме дополнительного соглашения, если обе стороны согласны внести такие изменения (ст.450 ГК РФ).
Поэтому в дополнительное соглашение, которое является неотъемлемой частью гражданско-правового договора, должны быть внесены изменения в преамбулу договора с указание статуса (индивидуальный предприниматель) с указанием номера и даты свидетельства о государственной регистрации, а также органа, выдавшего документ, кроме того, к такому дополнительному соглашению, как правило, прилагается копия свидетельства о регистрации ИП.
Однако, в практике делового оборота, бухгалтерия, чтобы избежать неприятностей с налоговой или по иным основаниям, предпочитают расторгнуть договор с физическим лицом и заключить заново с ИП (если это не договор аренды). Как вариант возможны и такие действия.
Это связано с тем что в соответствии со ст.227 Налогового кодекса РФ физические лица, зарегистрированные как индивидуальные предприниматели, исчисление и уплату НДФЛ осуществляют самостоятельно по суммам доходов, полученных от осуществления такой деятельности, поэтому при заключении договора с индивидуальным предпринимателем организация(компания) освобождается от обязанностей налогового агента.