Добрый день.
Если Вы увольняетесь по окончании контракта, то Вас уволят без обеспечения жилищной субсидией.
Гарантии сохранения на военной службы установлены только для следующих категорий военнослужащих, которые при наличии 10 лет общей продолжительности военной службы увольняются по достижении ими предельного возраста пребывания на военной службе, состоянию здоровья или в связи с организационно-штатными мероприятиями.
На это указано в ст. 23 ФЗ «О статусе военнослужащих»
Военнослужащие — граждане, общая продолжительность военной службы которых составляет 10 лет и более, состоящие на учете в качестве нуждающихся в жилых помещениях в федеральном органе исполнительной власти или федеральном государственном органе, в которых федеральным законом предусмотрена военная служба, без их согласия не могут быть уволены с военной службы по достижении ими предельного возраста пребывания на военной службе, состоянию здоровья или в связи с организационно-штатными мероприятиямибез предоставления им жилых помещений или жилищной субсидии, за исключением случаев, предусмотренных абзацем третьим настоящего пункта.
Увольнение в связи с окончанием контракта не позволяет Вас отнести к числу указанных лиц и Вы увольняетесь на общих основаниях, с получением жилищной субсидии уже после увольнения с военной службы.
При этом Вас не могут снять с учета в качестве нуждающихся.
Так в силу ст. 15 Закона
13. Граждане, уволенные с военной службы, общая продолжительность военной службы которых составляет 20 лет и более, а при увольнении с военной службы по достижении ими предельного возраста пребывания на военной службе, по состоянию здоровья или в связи с организационно-штатными мероприятиями при общей продолжительности военной службы 10 лет и более, не обеспеченные на момент увольнения с военной службы жилищной субсидией или жилыми помещениями, не могут быть без их согласия сняты с учета в качестве нуждающихся в жилых помещениях по последнему перед увольнением месту военной службы и обеспечиваются жилищной субсидией или жилыми помещениями в порядке, предусмотренном настоящим Федеральным законом для военнослужащих.
Если касается вопроса получения субсидии, то в силу приказа Министра обороны РФ от 21.07.2014 N 510
Вам нужно будет представить соответствующий договор и заявление о начислении субсидии.
Далее как отмечено в приказе