Здравствуйте, Ольга!
Согласно части 1 статьи 36 Федеральный закон от 13.07.2015 N 218-ФЗ «О государственной регистрации недвижимости» при представлении лицом, указанным в Едином государственном реестре недвижимости в качестве собственника объекта недвижимости, или его законным представителем заявления о невозможности государственной регистрации перехода, прекращения, ограничения права и обременения такого объекта недвижимости без его личного участия (далее в настоящей статье — заявление о невозможности регистрации) в Единый государственный реестр недвижимости в срок не более пяти рабочих дней со дня приема органом регистрации прав соответствующего заявления вносится запись о заявлении о невозможности регистрации.
Форма данного заявления утверждена Приказом Минэкономразвития России от 08.12.2015 N 920.
Директору (или собственнику) необходимо лично обратиться в Росреестр или МФЦ и написать указанное заявление. Образец заполнения заявления предоставят в госоргане. При себе необходимо иметь документы, подтверждающие право собственности на недвижимость и паспорт.
Что мешает собственнику обратиться в Росреестр? Если такое заявление от собственника будет в Росреестре, то никакой регистрации без его участия не произойдёт. Это во-первых. А во-вторых, никакая бухгалтерия не может поменять директора. Почему Вы пришли к такому выводу? В зависимости от формы юридического лица процедура может отличаться, но это не так просто.