Здравствуйте, Наталья!
В соответствии с частью 1.1 статьи 31 Федерального закона от 05.04.2013 N 44-Ф «О контрактной системе в сфере закупок товаров, работ, услуг для обеспечения государственных и муниципальных нужд» заказчик вправе установить требование об отсутствии в предусмотренном настоящим Федеральным законом реестре недобросовестных поставщиков (подрядчиков, исполнителей) информации об участнике закупки.
Судя по тому, что предложение о заключении исходит от заказчика, такое требование им не установлено. Предлагаю все же уточнить этот момент у заказчика.
Если такого требования нет, то компания вправе заключить договор.
С уважением, Светлана.