Как я могу получить паспорт на территории РФ?

Здравствуйте, Вера!

Если речь идет о паспорте гражданина Молдовы, то получить его вы можете в посольстве МОлдовы. https://rusia.mfa.gov.md/ru/content/оформление-заграничного-паспорта

Но даже, если вы получите паспорт, вам необходимо будет делать выезд из РФ на 90 суток. Подать в миграцию МВД РФ какие-либо документы возможно только при наличии законной регистрации в РФ.

ФЗ-115

Срок временного пребывания в Российской Федерации иностранного гражданина, прибывшего в Российскую Федерацию в порядке, не требующем получения визы, не может превышать девяносто суток суммарно в течение каждого периода в сто восемьдесят суток, за исключением случаев, предусмотренных настоящим Федеральным законом, а также в случае, если такой срок не продлен в соответствии с настоящим Федеральным законом. При этом непрерывный срок временного пребывания в Российской Федерации указанного иностранного гражданина не может превышать девяносто суток.

грозит ли мне депортация

Вера

Да возможно.

ФЗ-114 статья 26

8) в период своего предыдущего пребывания в Российской Федерации не выехали из Российской Федерации до истечения тридцати суток со дня окончания срока временного пребывания, за исключением случаев отсутствия возможности покинуть территорию Российской Федерации по обстоятельствам, связанным с необходимостью экстренного лечения, тяжелой болезнью или со смертью близкого родственника, проживающего в Российской Федерации, либо вследствие непреодолимой силы (чрезвычайных и непредотвратимых при данных условиях обстоятельств) или иных явлений стихийного характера, — в течение трех лет со дня выезда из Российской Федерации;

Для консультации, вы также можете обраться в чат, где есть возможность получить нужную Вам информацию на платной основе. 

Или воспользоваться функцией «Перезвоните мне» для консультации по телефону.
Моя специализация — миграционное законодательство.
Хорошего дня!