Имеют ли право штрафовать гражданина РФ за нарушение самоизоляции?

Здравствуйте. 

Имеют, можете не сомневаться. 

В теория права все права делятся на абсолютные права (права, которые не подлежат ограничению) и относительные права (права, которые могут быть ограничены).

Абсолютные права нельзя ограничить, к ним относятся право на жизнь (ст. 20 Конституции), право на охрану достоинства личности (ст. 21), право на неприкосновенность частной жизни, личную и семейную тайну, защиту чести и доброго имени (ч. 1 ст. 23), свободу совести и вероисповедания (ст. 28) и т.п. Данные права не подлежат ограничению.

А есть и относительные права, которые, исходя из интересов государства и личности, можно ограничить в определенных случаях. К этим правам относится и право свободно перемещаться. 

Вы же не будете спорить, что нельзя свободно перемещаться в приграничной зоне, на территории в/частей, полигонов и особо охраняемых объектов? Несовершеннолетние не могут перемещаться в ночное время без сопровождения взрослых. А работник по своему усмотрению не вправе покинуть территорию предприятия в рабочее время.

Такие же ограничения действуют и при угрозе массовых заболевания (режима повышенной готовности). Если граждане не будут соблюдать определенные ограничения, то из-за этого могут пострадать многие люди. То есть будет нарушено их абсолютное право на жизнь. 

В связи с этим органы власти в пределах своей компетенции вправе вводить различные ограничительные мероприятия, например, административную ответственность за нарушение режима самоизоляции. И никаких нарушений в этом нет. 

С уважением.