Здравствуйте Максим.
В соответствии со статьей 11 Трудового кодекса Российской Федерации -ТК РФ Статья 11. Действие трудового законодательства и иных актов, содержащих нормы трудового права -http://www.consultant.ru/docum...
Учредители не отнесены данной статьей к лицам на которых не распространяются трудовое законодательство и иные акты, содержащие нормы трудового права
Об этом свидетельствует и официальная позиция Роструда РФ по официальной ссылке:
Учитывая изложенное, полагаем, что заключение трудового договора в подобном случае не только правомерно, но и необходимо, поскольку невыполнение этой обязанности со стороны работодателя (общества) может повлечь административную ответственность, предусмотренную ст. 5.27 Кодекса РФ об административных правонарушениях.
https://онлайнинспекция.рф/que...
Т.е. в такой ситуации правильным и соответствующим действующему трудовому законодательству, будет оформление трудовых правоотношений с работником т.е. с генеральным директором и заключение с ним трудового договора.
Нужно принять на должность в рамках оформленных с ним трудовых правоотношений чего требует законодательство РФ, к примеру на должность заместителя генерального директора, оформить с ним трудовые правоотношения ввести должность в штатное расписание, утвердить должностные обязанности, генеральный директор вправе его своим приказом наделить дополнительной необходимыми полномочиями на период своего нахождения в отпуске, а также оформить доверенность.
В таком порядке все будет оформлено верно и по закону, что исключит в дальнейшем возможные риски и претензии со стороны контролирующих органов и ведомств.
Дополнительные разъяснения например также по ссылке:https://www.klerk.ru/buh/artic...
Каким образом оформить такой трудовой договор, кто является его сторонами, какие специфические формулировки необходимо использовать в договоре, нужно ли при этом писать заявление о приеме на работу?
Да это необходимо.
Т.е. оформление трудовых правоотношений путем подачи заявления, заключения трудового договора, вынесения приказа с которым работнику нужно ознакомить под роспись.
Во вложении к ответу типовые формы рекомендованные Рострудом РФ.
Образец решения единственного учредителя о назначении генерального директора ООО можете взять по следующей ссылке:
https://nalog-nalog.ru/ooo/obrazec_resheniya_uchreditelej_o_naznachenii_direktora/#%D0%A0%D0%B5%D1%88%D0%B5%D0%BD%D0%B8%D0%B5%20%D0%B5%D0%B4%D0%B8%D0%BD%D1%81%D1%82%D0%B2%D0%B5%D0%BD%D0%BD%D0%BE%D0%B3%D0%BE%20%D1%83%D1%87%D1%80%D0%B5%D0%B4%D0%B8%D1%82%D0%B5%D0%BB%D1%8F%20%D0%BE%20%D0%BD%D0%B0%D0%B7%D0%BD%D0%B0%D1%87%D0%B5%D0%BD%D0%B8%D0%B8%20%D0%B3%D0%B5%D0%BD%D0%B5%D1%80%D0%B0%D0%BB%D1%8C%D0%BD%D0%BE%D0%B3%D0%BE%20%D0%B4%D0%B8%D1%80%D0%B5%D0%BA%D1%82%D0%BE%D1%80%D0%B0%20%D0%9E%D0%9E%D0%9E
В Письме Федеральной службы по труду и занятости от 28 декабря 2006 г. № 2262-6-1 также указано, что в указанном Вами случае трудовой договор с генеральным директором как с работником не заключается.
https://www.garant.ru/products/ipo/prime/doc/12051781/