Не будет ли в дальнейшем сделка признана недействительной?

Здравствуйте Елена.

Реконструкцией называют изменение капитального строения. К ней относится перенос оконных проемов, увеличение или уменьшение этажности здания, расширение площади строения, все перемены, которые не соответствуют техническому паспорту сооружения, требуют разрешения на реконструкцию жилого дома.

Разрешение на реконструкцию необходимо получить в администрации. В вашем случае надстройка не узаконена до сих пор и значит, с большой долей вероятности, административный порядок не был соблюдён. Такие изменения параметров дома законодательство определяет как самовольная постройка.

Ст. 222 ГК РФ

Самовольной постройкой является здание, сооружение или другое строение, возведенные или созданные на земельном участке, не предоставленном в установленном порядке, или на земельном участке, разрешенное использование которого не допускает строительства на нем данного объекта, либо возведенные или созданные без получения на это необходимых в силу закона согласований, разрешений или с нарушением градостроительных и строительных норм и правил, если разрешенное использование земельного участка, требование о получении соответствующих согласований, разрешений и (или) указанные градостроительные и строительные нормы и правила установлены на дату начала возведения или создания самовольной постройки и являются действующими на дату выявления самовольной постройки.

Оценщик всё это зафиксирует и вы получите отказ в банке.

ст. 222 ГК РФ

Право собственности на самовольную постройку может быть признано судом

Но признано должно быть до оценки.

С уважением, Валерий.