Могу ли я вернуть деньги, если есть чек об оплате

Здравствуйте. 

Да, можете, либо можете зачесть данные денежные средства в качестве последующего проживания (которое, опять же, Вам должны обеспечить). 

Все известные мне образовательные учреждения (в том числе то, где я обучаюсь в качестве магистранта) предоставили возможность возврата денежных средств в упрощенном порядке посредством подачи заявления.

Попробуйте свяжитесь с комендантом и уточните этот момент. Далее обратитесь с письменным заявлением.

При невозможости достичь согласия обращайтесь в Роспотребнадзор, Прокуратуру, суд.

Удачи.