Скажите пожалуйста, увольняюсь по истечению срока контракта, хотел пройти профессиональную переподготовку, но мне сказали что уже поздно (за 3 месяца до окончания контракта)

Здравствуйте, Антон!
Ответ на Ваш вопрос зависит от того, в каких пограничных органах Вы служите.
Если речь идет о пограничных войсках, то согласно п. 4 раздела II Приложения № 1 «Порядок и условия профессиональной переподготовки по одной из гражданских специальностей отдельных категорий военнослужащих — граждан Российской Федерации, проходящих военную службу по контракту» к приказу Министра обороны РФ от 21 октября 2015 г. № 630, Военнослужащие, увольняемые с военной службы по истечении срока военной службы и изъявившие желание пройти профессиональную переподготовку, подают рапорт командирам (начальникам) воинских частей — не ранее чем за год до истечения срока контракта с учетом сроков, обеспечивающих их направление на профессиональную переподготовку во время прохождения военной службы.
Если же речь идет о Пограничных подразделениях ФСБ, то согласно Приложению № 1 к Приказу ФСБ РФ от 26 января 2009 г. № 22 «О порядке и условиях реализации военнослужащими органов федеральной службы безопасности, проходящими военную службу по контракту, права на профессиональную переподготовку по одной из гражданских специальностей», то направление военнослужащих на профессиональную переподготовку осуществляется на основании их рапорта при условии, что общая продолжительность военной службы в календарном исчислении составляет пять лет и более (не считая времени обучения в военных образовательных учреждениях высшего и среднего профессионального образования) в год увольнения с военной службы по истечении срока военной службы.
Если Вам нужна правовая помощь и поддержка в решении данного дела буду рад помочь! Обращайтесь!