Является ли ИП с сотрудниками организацией

Здравствуйте, Anas

Являюсь ли я организацией

Anas

нет, не являетесь, организация — это юридическое лицо (ст. 23, глава 4 ГК РФ, ст. 11 НК РФ).

какое разрешение ИП должно давать себе на подписание документов электронной подписью?

Anas

не разрешение от Вас требуют, нужно приложить документы, которые подтверждают, что тот, кто подписал своей электронной подписью проектную документацию, поданную в электронном виде, имеет право это делать от Вашего имени. 

Если это была Ваша эл.подпись (на Вас оформлена), следовательно должны быть документы, подтверждающие Ваш статус как индивидуального предпринимателя (свидетельство  /выписка ЕГРИП) и Ваш паспорт.

Если это была не Ваша ЭП, то нужна доверенность, выданная вами, как индивидуальным предпринимателем лицу, которое подписало документацию. Доверенность от имени индивидуального предпринимателя оформляется в порядке, аналогичном порядку, предусмотренному для физических лиц.  В установленных законодательством случаях доверенность должна быть оформлена нотариально.

Постановление Правительства Москвы от 25.10.2011 N 508-ПП ) «Об организации переустройства и (или) перепланировки помещений в многоквартирных домах»  указывает на требование, чтобы доверенность от имени физического лица была нотариально удостоверена, однако, указано это только для физ.лиц-заявителей. 

Как я понимаю, Вы не являетесь заявителем в данном случае, поэтому, полагаю, доверенность «подписанту» может быть выдана и в простой письменной форме. Однако, во избежание задержек и споров, я бы рекомендовала все-таки оформить ее нотариально.