Куда и как лучше подать иск/жалобу на признание отношений трудовыми?

Добрый день! Для того, что бы полноценно ответить на Ваши вопросы необходимо детально изучить ситуацию и документы (переписку, договоры, выписки по счету и т.д.), что не возможно выполнить в рамках данного вопроса. 

Но все же с учетом указанных вопросов и при том варианте, что подано в АС  в отношении Вас иск и его рассмотрение будет в упрощенном порядке, то

Вы вправе заявить ходатайство о рассмотрении с общем порядке

так согласно АПК РФ:

АПК РФ Статья 227. Дела, рассматриваемые в порядке упрощенного производства

5.Суд выносит определение о рассмотрении дела по общим правилам искового производства или по правилам административного судопроизводства, если в ходе рассмотрения дела в порядке упрощенного производства удовлетворено ходатайство третьего лица, заявляющего самостоятельные требования относительно предмета спора, о вступлении в дело, принят встречный иск, который не может быть рассмотрен по правилам, установленным настоящей главой, либо если суд, в том числе по ходатайству одной из сторон, пришел к выводу о том, что: 2) необходимо выяснить дополнительные обстоятельства или исследовать дополнительные доказательства, а также провести осмотр и исследование доказательств по месту их нахождения, назначить экспертизу или заслушать свидетельские показания;

Возможно придется заявлять в качестве третьего лица организацию, которая Вам переводила денежные средства за услуги.

Относительно же признания отношений трудовыми —

ТК РФ Статья 19.1. Трудовые отношения, возникающие на основании трудового договора в результате признания отношений, связанных с использованием личного труда и возникших на основании гражданско-правового договора, трудовыми отношениями

Признание отношений, возникших на основании гражданско-правового договора, трудовыми отношениями может осуществляться:
судом в случае, если физическое лицо, являющееся исполнителем по указанному договору, обратилось непосредственно в суд, или по материалам (документам), направленным государственной инспекцией труда, иными органами и лицами, обладающими необходимыми для этого полномочиями в соответствии с федеральными законами.

Для признания трудовыми отношениями, возникших на основании договора услуг нужны доказательства (документы, переписка и т.д.). 

как пример решение https://sud-praktika.ru/preced...

Срок подачи возражения на иск 10.09

на данный момент можно пока формально направить в суд возражение и заявить ходатайство о привлечении третьим лицом организацию, направляющую Вам оплату и ходатайство о рассмотрении дела в общем порядке.

 Куда и как лучше подать иск/жалобу на признание отношений трудовыми? 

В соответствии с ГПК РФ Статья 29. Подсудность по выбору истца

6.3. Иски о восстановлении трудовых прав могут предъявляться также в суд по месту жительства истца.

Вы вправе обратиться в суд по месту своего жительства.

Стоит ли писать жалобу в налоговую, слышал что они своим решением могут признать отношения трудовыми?

можете написать жалобу в налоговую, но будет ли положительное решение для Вас не ясно. Но обращение лишним не будет.

Да, действительно такие решения были, но есть нюансы:

Верховный Суд Российской Федерации согласился с судами нижестоящих инстанций в том, что юрлицо, в отношении которого инспекция провела выездную налоговую проверку, создало «схемы» минимизации налогообложения для занижения налоговой базы по НДФЛ вследствие заключения гражданско-правовых договоров с 12 ИП, которые являлись работниками общества (Определение ВС РФ от 14 февраля 2019 г. № 304-КГ18-251241). Кроме того, организация необоснованно включила в состав налоговых вычетов суммы НДС, уплаченного по заключенным сделкам с ИП-работниками.

В ходе судебного разбирательства установлено, что ИП являются сотрудниками юрлица, работают по трудовым договорам, получают зарплату и оказывают консультационные услуги обществу по гражданско-правовым договорам в областях, по которым они специализируются как работники общества. Таким образом, договоры об оказании услуг обладают признаками трудовых договоров и фактически регулируют трудовые отношения. Суды указали, что наименование договора не может быть достаточным основанием для признания договора трудовым или гражданско-правовым.

Для дополнительной консультации с изучением документов  и ситуации в целом можете обратиться в чат.