Как добавить в дополнительное соглашение о компенсации расходов, понесенных исполнителем, сумму, которую нужно будет заплатить по налогу усн 6%?

Добрый день.  В соответствии с НК статья 8 налог это

обязательный, индивидуально безвозмездный платеж, взимаемый с организаций и физических лиц

Он не является расходом и не компенсируется, поскольку уплачивается индивидуально каждым лицом.  В Вашем случае он взимается с дохода получаемого в рамках ведения предпринимательской деятельности. 

Ваш контрагент не может его Вам компенсировать, поскольку налог индивидуализирован. Оплачивать его должны только Вы и именно с суммы Вашего дохода. Единственно возможный вариант — поднятие размера арендной платы в договоре.

Все иные вопросы могут быть детально разобраны в рамках отдельной полноценной услуги в чате( кнопка рядом с фото юриста, доступна при входе на сайт через браузер)

С уважением Евгений Беляев

Добрый день, Леван.

3.1. Компенсируемые по настоящему Дополнительному соглашению подтвержденные расходы, понесенные Исполнителем при уплате налога (УСН 6%) за доход, полученный за аренду помещения для хранения программно-аппаратного комплекса Заказчика за указанный период.