Все работы выполнены согласно проекта и приложенных документов в срок, но заказчик уже после заключения

Добрый день! Согласно условиям документации о закупке смета на выполнение работ была частью документации?

В документации к закупке была смета, проект договора и проект

в силу ст. 709 ГК РФ

Цена работы может быть определена путем составления сметы.
В случае, когда работа выполняется в соответствии со сметой, составленной подрядчиком, смета приобретает силу и становится частью договора подряда с момента подтверждения ее заказчиком.

Подрядчик обязан осуществлять строительство и связанные с ним работы в соответствии с технической документацией, определяющей объем, содержание работ и другие предъявляемые к ним требования, и со сметой, определяющей цену работ.

Смета является неотъемлемой частью договора (приложением к договору).

что за составление сметной документации несет ответственность подрядчик?

В данном случае формулировка о том, что за составление сметы несет подрядчик не основано на законе. 

Здравствуйте!

Федеральный закон «О закупках товаров, работ, услуг отдельными видами юридических лиц» от 18.07.2011 N 223-ФЗ, ст.3.2

Вправе ли заказчик ссылать на ошибки в смете (ведь по идее он должен был проверить её до объявления конкурсной процедуры и до заключения контракта), существенно снижать из-за этого итоговую цену контракта, хотя работы уже выполнены на 97% и говорить, что за составление сметной документации несет ответственность подрядчик?

Все верно — заказчик обязан был проверить смету еще до объявления конкурентной процедуры ( конкурса), до заключения контракта.

Смету составляли мы ещё до опубликования процедуры. 

только об этом никому не говорите.Это обязанность заказчика — составить смету, проект договора, документацию для выставления на торги.

Согласно ст.743 ГК РФ

1. Подрядчик обязан осуществлять строительство и связанные с ним работы в соответствии с технической документацией, определяющей объем, содержание работ и другие предъявляемые к ним требования, и со сметой, определяющей цену работ.

При отсутствии иных указаний в договоре строительного подряда предполагается, что подрядчик обязан выполнить все работы, указанные в технической документации и в смете.

Также надо смотреть заключенный договор. Однако, Вы можете не соглашаться на существенное изменение цены контракта. В любом случае изменение заключенного договора осуществляется по соглашению сторон, либо в судебном порядке, ст.450-452 ГК РФ.