Если да то что для этого нужно и какие есть нюансы?

Добрый день. Дмитрий, отвечу на ваш вопрос. 

Вы написали: 

могу ли Я подать заявление на альтернативную гос службу? 

Да, можете, это право гражданина, но данное право у Вас возникает при определенных условиях, так в силу статьи 2 Федерального закона «Об альтернативной гражданской службе»: 

Гражданин имеет право на замену военной службы по призыву альтернативной гражданской службой в случаях, если:

— несение военной службы противоречит его убеждениям или вероисповеданию;

— он относится к коренному малочисленному народу Российской Федерации, ведет традиционный образ жизни, осуществляет традиционную хозяйственную деятельность и занимается традиционными промыслами коренных малочисленных народов Российской Федерации.

Далее: 

 Если да то что для этого нужно и какие есть нюансы?

Вам необходимо будет подать заявления о замене военной службы по призыву альтернативной гражданской службой в военный комиссариат, где вы состоите на воинском учете. Сроки подачи заявления определены статьей 11 Федерального закона «Об альтернативной гражданской службе»:

до 1 апреля — граждане, которые должны быть призваны на военную службу в октябре — декабре текущего года;

до 1 октября — граждане, которые должны быть призваны на военную службу в апреле — июне следующего года.

В заявлении о замене военной службы по призыву альтернативной гражданской службой гражданин указывает причины и обстоятельства, побудившие его ходатайствовать об этом.

К заявлению прилагаются автобиография и характеристика с места работы и (или) учебы гражданина (для работающих (работавших) и (или) обучающихся (обучавшихся)). К заявлению гражданин вправе приложить другие документы. В заявлении гражданин вправе указать лиц, которые согласны подтвердить достоверность его доводов о том, что несение военной службы противоречит его убеждениям или вероисповеданию.