Здравствуйте, Наталья.
Есть две возможные причины создавшейся ситуации.
1. Ваша мама при оформлении наследства не обратилась за выдачей свидетельства о праве собственности на долю в общем имуществе (ст. 75 Основ законодательства Российской Федерации о нотариате" (утв. ВС РФ 11.02.1993 N 4462-1).
Если бы она обратилась с таким заявлением, то ей бы выдали свидетельство о праве собственности на 1/2 долю как пережившей супруге, а другая 1/2 доля была бы включена в свидетельство о праве на наследство, а затем она бы полностью оформила дом в свою единоличную собственность.
А теперь доля в праве собственности на дом осталась невыделенной, что исключает и наследование этой доли (нельзя наследовать то, чего нет), поэтому на эту долю и не было вручено свидетельство о праве на наследство.
2. Второй вариант, что с домом что-то юридически «не чисто» и нотариус отказался выдавать на него свидетельство отправив Вашу маму в суд.
Но в любом случае решать вопрос с оформлением дома нужно, иначе пока в ЕГРН будет запись, что он находится в совместной собственности с уже умершим лицом - продать его Вы не сможете.
Сначала пусть Ваша мама обратится к нотариусу, предоставив документы на дом и потребует выдать ей свидетельство на на долю пережившего супруга и свидетельство о праве на наследство 1/2 доли в порядке наследования.
Если по тем или иным причинам в выдаче таких документов будет отказано, то придется решать вопрос в судебном порядке.