Получается я остаюсь на улице да ещё и могу лишится детей?

Здравствуйте, Лаура! 

Согласно ч. 4 ст. 10 ФЗ «О дополнительных мерах государственной поддержки семей, имеющих детей»

Лицо, получившее сертификат, его супруг (супруга) обязаны оформить жилое помещение, приобретенное (построенное, реконструированное) с использованием средств (части средств) материнского (семейного) капитала, в общую собственность такого лица, его супруга (супруги), детей (в том числе первого, второго, третьего ребенка и последующих детей) с определением размера долей по соглашению.

муж купил квартиру(в браке)

Это не он купил, а вы совместно. 

СК РФ Статья 34. Совместная собственность супругов

1. Имущество, нажитое супругами во время брака, является их совместной собственностью.

 
2. К имуществу, нажитому супругами во время брака (общему имуществу супругов), относятся доходы каждого из супругов от трудовой деятельности, предпринимательской деятельности и результатов интеллектуальной деятельности, полученные ими пенсии, пособия, а также иные денежные выплаты, не имеющие специального целевого назначения (суммы материальной помощи, суммы, выплаченные в возмещение ущерба в связи с утратой трудоспособности вследствие увечья либо иного повреждения здоровья, и другие). Общим имуществом супругов являются также приобретенные за счет общих доходов супругов движимые и недвижимые вещи, ценные бумаги, паи, вклады, доли в капитале, внесенные в кредитные учреждения или в иные коммерческие организации, и любое другое нажитое супругами в период брака имущество независимо от того, на имя кого из супругов оно приобретено либо на имя кого или кем из супругов внесены денежные средства.

 
3. Право на общее имущество супругов принадлежит также супругу, который в период брака осуществлял ведение домашнего хозяйства, уход за детьми или по другим уважительным причинам не имел самостоятельного дохода.

Вы должны были выделить долю в квартире на детей. Кроме того, Вы имеете право на половину квартиры (или половину уже оплаченной суммы). Естественно, что после развода за ипотеку придется платить половину от платежа за нее. 

Здравствуйте. Что касается маткапитала я полностью согласен с коллегой выше.

Дополнительно скажу, что  в случае спора о том с кем останутся дети, судебная практика показывает, что приоритет на право оставить детей  при разводе принадлежит матери.  Особенно если дети еще малолетние, в силу ряда причин. Мнение ребенка учитывается с 10-летнего возраста.

Вероятность того, что суд определит место жительства детей с отцом близка к нулю, если Вы не ведете асоциальный образ жизни, заботитесь о них итд. Кроме того, при разводе этот вопрос решается только по заявлению одной из сторон.

Если Вам необходима дополнительная консультация либо помощь в составлении письменных документов, можете обратиться в мой чат. По правилам сайта услуги в чате платные.