Не знаю где работает официально

Здравствуйте, Анастасия!

Как лучше сделать?

 не совсем уместный вопрос, тут нет хуже или лучше. Вы можете выбрать из двух вариантов, которые предлагает закон:

1. обратиться в мировой суд с заявлением о выдаче судебного приказа на взыскание алиментов в долях от заработка (на двоих детей  — 1/3). Минус — суд. приказ отменяется немотивированными возражениями, тогда все равно придется повторно обращаться уже с иском, но сразу с иском обратиться нельзя, если просить алименты в долях от дохода;
2. обратиться в районный суд с иском о взыскании алиментов в твердой денежной сумме (ТДС) или ТДС + доля от дохода (ТДС указывается кратно прожиточному минимуму на ребенка в регионе проживания детей, обычно взыскивают от 0,5 ПМ на 1 ребенка, но можно просить и по 1 ПМ, а там уж как суд пойдет)

Бывший муж работает в Москве. Не знаю где работает официально. Но он помимо этого ещё и фрилансом зарабатывает

 это не имеет значения, Вы не обязаны знать место работы бывшего мужа. При этом неофициальные доходы пристав не имеет возможности найти, а официальное место работы найдет. 

Если у Вас еще остались вопросы, Вы можете задать их мне в рамках индивидуальной платной консультации в чате (стоимость и время консультации согласовываются там же).