Решила выделить супружескую долю из общей массы, не просрочила ли я с подачей заявления, если выделю 1 сентября, могут ли отказать?

Нет, у вас же нет 6 месяцев вообще и кроме того на выделение супружеской доли нет этого 6-ти месячного срока.

 Статья 1150. Права супруга при наследовании

Принадлежащее пережившему супругу наследодателя в силу завещания или закона право наследования не умаляет его права на часть имущества, нажитого во время брака с наследодателем и являющегося их совместной собственностью. Доля умершего супруга в этом имуществе, определяемая в соответствии со статьей 256 настоящего Кодекса, входит в состав наследства и переходит к наследникам в соответствии с правилами, установленными настоящим Кодексом.