Можно ли составить какое либо соглашение с бывшей женой чтобы ей организация перечисляла алименты более 50% от моей заработной платы

Если нет судебного решения по алиментам, Вы можете заключить соглашение об уплате алиментов,  нотариально. ( глава 16 Семейного кодекса РФ).

Если есть решение,  то надо подавать заявление о пересмотре размера алиментов в суде.

Добрый день!
Соглашением об алимнетах можно предусмотреть любую долю об оплате алиментов (ст. 103 Семейного кодекса). 
Организация будет удерживать алименты в соответствии с этим аоглашением (ст. 109 Семейного кодекса). 
Следовательно, это вопрос того, как вы пропишите соглашение об алиментах — указание доли более 50% возможно.