Здравствуйте.
Вопрос довольно злободневный и в практике региональных операторов (в Москве, где капитальный ремонт находится в ведении ФКР г. Москвы — уж точно) есть случаи, когда собственник не позволяет осуществлять капитальный ремонт, затрагивая принадлежащие ему помещения или их части, и тогда региональный оператор делает ремонт «в обход». То есть если Вы не согласитесь на вскрытие полов, его делать не будут, однако с Вас в таком случае могут быть взысканы убытки, а также лишить Вас доступа к различным инженерным коммуникациям, если это будет технически или технологически вынужденно.
Лицо, право которого нарушено, может требовать полного возмещения причиненных ему убытков, если законом или договором не предусмотрено возмещение убытков в меньшем размере.
Под убытками понимаются расходы, которые лицо, чье право нарушено, произвело или должно будет произвести для восстановления нарушенного права, утрата или повреждение его имущества (реальный ущерб), а также неполученные доходы, которые это лицо получило бы при обычных условиях гражданского оборота, если бы его право не было нарушено (упущенная выгода).
Статья 15 ГК РФ.
В практике, повторюсь, это встречается. По этой причине вариантов действий с Вашей стороны не так много: это либо договариваться с региональным оператором (попробуйте для начала написать их специалистам письменное обращение, а также, если есть такая возможность, запишитесь на прием к специалисту отдела капитального ремонта, если есть техническая возможность обойти Вашу часть помещений, сотрудники могут на это пойти), либо обжаловать действия и решения фонда капитального ремонта.
Как показывает практика, лучше всего действовать по всем направлениям, то есть обращаться и к руководству региона (которое в том числе создает регионального оператора), и в Прокуратуру, и в Жилищную инспекцию. Если все вышеуказанное не поможет, придется обращаться в суд.