Подскажите, пожалуйста, нужно ли указывать стоимость строительных материалов при заключении договора подряда с ООО и нужно ли платить налог на профессиональный доход с этих материалов?

Виктор, добрый вечер.

Вы оплачиваете, пробиваете электронный чек в приложении мой налог 6% и отправляете чек заказчику и все. 

оход с этих материалов? Дохода с материалов самозанятый не имеет.

 Виктор, добрый день! Доход это то, что Вы получаете от заказчика, в том числе оплату стоимости материалов приобретенных для исполнения договора подряда.