Если генеральный директор ООО будет одновременно и контролером технического состояния ТС по выпуску, то при каких либо нарушениях, будут привлекать его как Должностное лицо или как Юридическое лицо?

Здравствуйте, Виктория!

Административная ответственность  за  выпуск на линию транспортного средства, не зарегистрированного в установленном порядке, не прошедшего технического осмотра, с заведомо подложными государственными регистрационными знаками, имеющего неисправности, с установленными без соответствующего разрешения устройствами для подачи специальных световых или звуковых сигналов, предусмотрена ст.12.31 КоАП РФ.

Ответственность предусмотрена, как для должностных лиц, ответственных за техническое состояние и эксплуатацию транспортных средств, так   для юридических лиц. 

Более подробно по ссылке https://www.consultant.ru/document/cons_doc_LAW_34661/9ea898782c9b757a988def614fa84e1493938591/

о при каких либо нарушениях, будут привлекать его как Должностное лицо или как Юридическое лицо?

Привлечь могут, как  должностное лицо, так и юридическое, если это предусмотрено диспозицией статьи.

Из  судебной практике наличие в штате организации должностного лица, ответственного за выпуск транспортного средства на линию, не свидетельствует об отсутствии в действиях (бездействии) юридического лица состава административного правонарушения, предусмотренного ст. 12.31 КоАП РФ. 

Постановление Седьмого кассационного суда общей юрисдикции от 26 июня 2020 г. по делу N 16-1557/2020

Решение Кировского областного суда от 19 августа 2015 г. по делу N 77-466/2015