Добрый день.
Для РФ, как правило, важно не гражданство или ВНЖ иного государства, а налоговое резидентство. Если Вы налоговый резидент — пребывание в РФ 183 дня в году и более, НДФЛ у Вас будет в размере определенном для резидента вне зависимости от наличия гражданства или ВНЖ иного государства — статьи 207, 208, 209, 224 НК.
При этом для Израиля важен принцип центра жизненных интересов. Если он образуется, резидентство в Израиле возникает при нахождении в нем в течении 30 дней в году.
Отдельный момент — возможность регистрации ИП или самозанятости ( не путать с видами деятельности)для гражданина РФ не ограничена, для лица не имеющего гражданство РФ ИП возможно лишь при наличии РВП или ВНЖ. При этом спец.режимы, а к ним относятся и ПСН, и УСН, и НПД не подпадают под Конвенцию между Правительством Российской Федерации и Правительством Государства Израиль об избежании двойного налогообложения и предотвращении уклонения от налогообложения в отношении налогов на доходы www.consultant.ru/document/cons_doc_LAW_28920/
, в связи с чем возможны двойные налоги.
Вообще же Вы ведете речь о построении схемы деятельности оптимальной по налогам и рискам с учетом разных юрисдикций. Это требует разбора массы деталей и имеет массу нюансов, что возможно рассмотреть в рамках отдельной полноценной услуги в чате( кнопочка рядом с фото юриста, доступна при входе на сайт через браузер)
С уважением Евгений Беляев