В итоге чек не был выписал

Здравствуйте

Он услугу то ООО оказал, или что там у вас было по договору?

Риски невыдачи чека лежат на стороне самозанятого. Вы можете сдать отчетность на основании договора.

В случае чего налоговая проведет проверку, доначислит самозанятому налог и взыщет с него штраф.

Здравствуйте, Ренат.

В такой ситуации, так как самозанятый превысил предельный размер дохода 2,4 млн. руб. для ООО наступают налоговые последствия.

Во-первых, самозанятый после превышения лимита утрачивает право платить НПД с полученного дохода с даты превышения.

Во-вторых, ООО должно удержать НДФЛ с выплаты самозанятому (152 тыс. руб.), а также заплатить с этой суммы страховые взносы.

Об этом сказано, в частности в письме ФНС от 20 февраля 2019 г. N СД-4-3/2899@

При этом на юридическое лицо возлагается обязанность по исчислению и уплате НДФЛ и страховых взносов в отношении физического лица, не являющегося индивидуальным предпринимателем, с даты утраты последним права на применение специального налогового режима НПД (в том числе с даты превышения дохода 2,4 млн руб.).

Ответ дан, исходя из того, что самозанятый не имеет статус ИП.

Здравствуйте, Ренат!

В соответствии с абз. 1 ст. 309 ГК РФ, обязательства должны исполняться надлежащим образом. Вы со своим контрагентом заключили договор возмездного оказания услуг, который, согласно ч. 1 ст. 779 ГК РФ, предполагает следующее:

исполнитель обязуется по заданию заказчика оказать услуги (совершить определенные действия или осуществить определенную деятельность), а заказчик обязуется оплатить эти услуги.

Факт исполнения исполнителем (простите за тавтологию) своей части договора подтверждается актом приема оказанных услуг, который в силу ст. 720 ГК РФ составлять крайне желательно.

Факт исполнения заказчиком своей части договора, если он делал перевод с расчетного счета, подтверждается платежным поручением.

Так что никакой дебиторской задолженности у Вас нет: чек от самозанятого не входит в комплект закрывающих документов.