Если неправильно был заполнен протокол, то можно ли оспорить его

Здравствуйте, Павел!

Чтобы дать Вам полезный совет, Вам необходимо уточнить Ваш вопрос. Что за протокол, по какой статье какого закона (КоАП, УПК), когда составлен и кем?

Здравствуйте Павел! 
Для того чтобы разобраться с Вашим вопросом требуется ознакомиться с протоколом. 
Протокол об административном правонарушении составляется в соответствии со статьей 28.2 КоАП РФ

2. В протоколе об административном правонарушении указываются дата и место его составления, должность, фамилия и инициалы лица, составившего протокол, сведения о лице, в отношении которого возбуждено дело об административном правонарушении, фамилии, имена, отчества, адреса места жительства свидетелей и потерпевших, если имеются свидетели и потерпевшие, место, время совершения и событие административного правонарушения, статья настоящего Кодекса или закона субъекта Российской Федерации, предусматривающая административную ответственность за данное административное правонарушение, объяснение физического лица или законного представителя юридического лица, в отношении которых возбуждено дело, иные сведения, необходимые для разрешения дела.

Кроме того, согласно статьей 1.5 КоАП РФ 

1. Лицо подлежит административной ответственности только за те административные правонарушения, в отношении которых установлена его вина.

2. Лицо, в отношении которого ведется производство по делу об административном правонарушении, считается невиновным, пока его вина не будет доказана в порядке, предусмотренном настоящим Кодексом, и установлена вступившим в законную силу постановлением судьи, органа, должностного лица, рассмотревших дело.

3. Лицо, привлекаемое к административной ответственности, не обязано доказывать свою невиновность, за исключением случаев, предусмотренных примечанием к настоящей статье.

4. Неустранимые сомнения в виновности лица, привлекаемого к административной ответственности, толкуются в пользу этого лица.

Вместе с тем обстоятельства, исключающие производство по делу об административном правонарушении перечислены в статье 24.5 КоАП РФ.

Соответственно, в случае если протокол об административном правонарушении составлен с неустранимыми нарушениями, есть все шансы прекратить производство по этому делу.