В итоге звонит регистратор и говорит, что зарегестрировать право нельзя, и что теперь нужно доказывать право собственности через суд, так как договор купли-продажи 2000 года

Здравствуйте, уважаемая Регина! 

Росреестр, к сожалению отказал в госрегистрации права правомерно. 

В данном случае в целом, Права на имущество, подлежащие государственной регистрации, возникают, изменяются и прекращаются с момента внесения соответствующей записи в государственный реестр – это аксиома имущественных отношений, которая закреплена законодателем в пункте 2 статьи 8.1 Гражданского кодекса РФ. 

В пункте 1 статьи 131 ГК РФ установлено, что право собственности и другие вещные права на недвижимые вещи, ограничения этих прав, их возникновение, переход и прекращение подлежат государственной регистрации. 

Соответственно, право собственности на недвижимое имущество подлежит государственной регистрации и возникает именно с момента внесения соответствующей записи в государственный реестр. 

В современных реалиях встречаются случаи, когда продавец передал недвижимое имущество покупателю по договору купли-продажи, стороны зафиксировали передачу в акте приёма-передачи, но действий по регистрации перехода права собственности не совершили.

То есть недвижимое имущество передано, но стороны забыли (или не знали) зарегистрировать переход права собственности в установленном порядке.

Проанализировав ваши документы, действительно с учетом того, что у Вас договор ранее заключен договор купли-продажи 2000 г. и передаточный акт не прошел государственную регистрацию в учреждении юстиции (смотреть на обороте), у Вас есть законные основания сейчас можете подать исковое заявление в суд о признании права собственности и дальнейшей регистрации права в Росреестре.

Всего доброго Вам!