Добрый день.
Нет, налог платить не нужно. Вычет, т.е. сумма, с которой налог не платится, как раз и составляет 250т.р.
п.п.1 п.2 статьи 220 Налогового кодекса:
имущественный налоговый вычет предоставляется в размере доходов, полученных налогоплательщиком в налоговом периоде от продажи жилых домов, квартир, комнат, включая приватизированные жилые помещения, дач, садовых домиков или земельных участков или доли (долей) в указанном имуществе, находившихся в собственности налогоплательщика менее трех лет, не превышающем в целом 1 000 000 рублей, а также в размере доходов, полученных в налоговом периоде от продажи иного имущества (за исключением ценных бумаг), находившегося в собственности налогоплательщика менее трех лет, не превышающем в целом 250 000 рублей;
автомобиль относится к «иному имуществу»