Если был сделан приказ по школе на работника как ответственного за эксплуатацию тахографа и глонасс, могут ли они выписать протокол на юр.лицо?

Здравствуйте.

Собственником транспортного средства является образовательная организация, поэтому привлечение её к административной ответственности обосновано. 

Что касается работника, если он ненадлежащим образом исполняет свои должностные обязанности, что привело к привлечению работодателя к ответственности, можете наложить на него дисциплинарное взыскание. 

Андрей!

Важно в таком случае понимать — ответственность за обеспечение оборудования транспорта системой Глонасс лежит не на конкретных сотрудниках, они по правилам Трудового Кодекса РФ исполняют свои обязанности по трудовому договору и отвечают за неисполнение, например, указаний руководителя. Если же обязанности, установленные законом, не исполняет организация, то и отвечать должна она. В рамках разбирательства и при возможном обжаловании решения школа может просить о снижении размера штрафа, у бюджетного учреждения шансы есть.

Всего доброго!