Здравствуйте!
Основание проведения перепланировки помещения в многоквартирном доме является согласование с органом местного самоуправления, ст.26 ЖК РФ.
Последствия самовольного переустройства и (или) самовольной перепланировки помещения в многоквартирном доме указаны в ст.29 ЖК РФ. В том числе административная ответственность за самовольные переустройство и (или) перепланировка помещения в многоквартирном доме по ст.7.21 КоАП РФ.
При этом при решении вопроса о перепланировке должен быть предоставлен подготовленный и оформленный в установленном порядке проект перепланировки перепланируемого помещения в многоквартирном доме, а если перепланировка помещения в многоквартирном доме невозможны без присоединения к данному помещению части общего имущества в многоквартирном доме, также протокол общего собрания собственников помещений , где должно быть зафиксировано согласие всех собственников помещений в многоквартирном доме на такую перепланировку помещения. То есть протокол общего собрания собстенников нужен только том случае если было задействовано общее имущество МКД ( ст.36 ЖК РФ).Если общее имущество не затрагивалось, то данный документ и не нужен.
Все изменения по перепланировке, разделу помещений, псстановке новых помещений на кадастровый учет и регистрацию должны были пройти в установленной законом процедуре с участием органов БТИ ( кадастрового инженера), администрации и Росреестра.
Полагаю, что проблем с регистрацией праа собственности на помещение у Вас не должно быть, если Вы пишите, что документы по итогу оформлены правильные и все это прошло через Росреестр.
Но если не была соблюдена процедура, например, не был предоставлен в уполномоченный орган( администрацию) проект перепланировки или не было согласие собственников( если оно требовалось так как затрагивалось общее имущество МКД), то при наличии жалоб данный вопрос может встать. В том числе если будет прокурорская проверка.
Тогда вопросы могут быть к Вам и администрации как согласовывающему органу.
Тем не менее думаю, что это Вы из-за этого не потеряете право собственности.
Если Вам потребуется дополнительная консультация, то можете обратиться ко мне в чат.