Или вся квартира перейдет к нам в равные доли, то есть у всех будет по 1/3?

Алена, здравствуйте!

Хочу выкупить у мамы оставшуюся 1/3 за мат капитал.Как вообще происходит этот процесс.

Для начала надо заключить договор купли-продажи 1/3 доли в праве общей долевой собственности на квартиру.В договоре указать что покупаете  указанную долю у своей матери за… которые должны
были быть оплачены продавцу за счёт средств материнского (семейного) капитала с их перечислением на счёт продавца после государственной регистрации перехода права собственности.  Далее, после регистрации права
общей долевой собственности в Управлением Росреестра Вам надо написать заявление о распоряжении средствами материнского (семейного) капитала и о  направлении денежных средств по государственному сертификату на материнский капитал в счёт уплаты основного долга по договору купли-продажи доли в праве общей долевой собственности на жилое помещение. После приобретения доли в праве собственности на
квартиру, ваши дети станут в полном объёме обладателями правомочий собственника жилого помещения (право владения, пользования и распоряжения своим имуществом в соответствии с положениями статьи 209 ГК РФ.

У моего старшего сына остаётся 2/3 и мы делим эту 1/3 которую покупаем на нас троих.??

Все правильно.

В данной ситуации вы покупаете за маткапитал 1/3 доли мамы. Так как в покупку вкладывается маткапитал, то 1/3 делится между троими: т.е. по 1/9 каждому из троих.

В результате у вашего старшего ребенка будет 2/3 + 1/9 = 7/9

у вас — 1/9

у вашего младшего ребенка — 1/9.

В данной ситуации ваш старший взрослый ребенок имеет право впоследствии в судебном порядке выкупить у вас 1/9 доли квартиры как незначительную долю (ст. 252 ГК РФ). Когда ваш младший ребенок станет совершеннолетним, то старший взрослый так же может поступить и с младшим.

Так же ваш старший взрослый ребенок имеет право впоследствии продать свои 7/9 доли с учетом правил ст. 250 ГК РФ